נולד בליטא. כשהיה נער למד כמה שנים בישיבות, אך כשמלאו לו שש עשרה שנה הודיע להוריו שאינו רוצה להמשיך ללמוד בבית המדרש; לדעתו חובה על כל יהודי לעבוד עבודה של ממש בארץ ישראל.
בשנת 1905 עלה ארצה והתיישב בפתח תקווה כפועל. הוא התמחה ברוב תחומי העבודה החקלאית ובייחוד בטיפול בבעלי חיים.
לאחר שקנה חלקת אדמה בכפר סבא, נטע בה כרם ועסק גם בעבודות שונות במושבה. רפופורט למד להכיר את סביבת כפר סבא וקיבל על עצמו את השמירה. רכוב על סוסו היה מסייר בכל הסביבה ושמר על כפר סבא ועל כרמֵי עין-חי (עין-חי היה שמו הראשון של המושב כפר מל"ל, הנמצא בין כפר סבא להוד השרון).
כשהיה בעל משפחה ויתר על אחד משני החדרים בביתו הקטן כדי שישמש ספרייה ואחר כך גן ילדים. כשהגיעו לכפר סבא היהודים שגורשו מיפו בידי הטורקים, רפופורט מסר את ביתו לרשות ועד המושבה, כדי שאפשר יהיה לשכן בו פליטים.
נתן רפופורט האמין בעבודה עברית. סיפרו עליו שדרש הרבה מעצמו ומאחרים, והעריץ את החלוצים על עבודתם המסורה. בימי המאורעות ביפו (בשנת 1921) התגייס לארגון ה"הגנה" ונהרג בהגנה על העיר פתח תקווה.
נתן רפופורט
התמונה מתוך הספר : שלמה אנגל, כפר סבא, 70 שנה לייסוד כפר סבא (תרס"ג - 1903) 80 שנה לגאולת אדמתה, הוצאת עיריית כפר סבא, תשל"ג - 1973